イントラネットということで、簡易的なセキュリティ設定でPukiWikiを設置する方法を示します。
PukiWikiは、PHPで動作するアプリケーションですので、
ApacheのインストールとPHPのインストールを済ませておいてください。
ダウンロードしたファイルはzip圧縮されていますので、適当なツールで解凍し、Apacheのドキュメントルートにコピー(移動)します。
http.confを編集して、DirectryIndexディレクティブに対し、「index.php」を追加します。

pukiwiki.ini.phpを編集します。
編集する箇所は、2箇所です。
ホスト名を適宜修正します。
管理パスワードを変更します。sdminpassを検索して、適宜修正します。
ここでは安易な"passwd"と設定しています。(ダミーです。)

イントラネットに設置するということで、Wikiの管理パスワードは共有されるでしょうし、
サーバーとして設置されたPCは共有PCでしょうから、パスワードを隠したとしてもばれてしまいますから、この程度でよいと思います。
以上です。